Basics of Bioinformatics - Plan Szkolenia

To prowadzone przez instruktora szkolenie na żywo w Polsce (na miejscu lub zdalnie) jest przeznaczone dla biologów, którzy chcą korzystać z Biopython.

Po zakończeniu tego szkolenia uczestnicy będą w stanie

• Integrować koncepcje biologiczne z technologiami informatycznymi w celu rozwiązywania problemów badawczych.
• Wydobywać informacje z dużych zbiorów danych pochodzenia biologicznego.
• Tworzyć algorytmy dla podstawowych zadań badawczych.

To szkolenie prowadzone przez instruktora, na żywo w Polsce (online lub na miejscu) jest skierowane do profesjonalistów i pracowników służby zdrowia, którzy chcą zdobyć wiedzę na poziomie średnio zaawansowanym do zaawansowanego na temat różnych operacji związanych z sekwencjonowaniem i testowaniem genetycznym.

Pod koniec tego szkolenia uczestnicy będą mogli:

• Poznać i zrozumieć kluczowe koncepcje genetyki.
• Zrozumieć, jak działają operacje sekwencjonowania i testowania genetycznego.

Dobra Praktyka Kliniczna (GCP) to zbiór wytycznych dotyczących badań klinicznych prowadzonych na ludziach. GCP stanowi międzynarodowy standard projektowania, prowadzenia, monitorowania, dokumentowania, analizowania i raportowania badań klinicznych.

W tym szkoleniu prowadzonym przez instruktora, uczestnicy poznają najważniejsze wytyczne i podstawowe zasady stosowane w Dobrej Praktyce Klinicznej (GCP) w badaniach klinicznych i badaniach z udziałem ludzi. Kurs ten zapewnia przegląd różnych obszarów GCP, z nieco większym naciskiem na GCP oparte na ICH dotyczące badań nad lekami i produktami biologicznymi.

Po zakończeniu szkolenia uczestnicy będą mogli:

• Zrozumieć podstawowe zasady GCP dotyczące badań nad lekami i produktami biologicznymi, oparte na Międzynarodowej Konferencji Harmonizacji (ICH)
• Zastosować wytyczne określone przez GCP w swoich badaniach klinicznych i badaniach

Grupa docelowa

• Badacze kliniczni
• Profesjonaliści zajmujący się badaniami klinicznymi
• Specjaliści ds. zdrowia i medycyny
• Personel wspierający badania kliniczne
• Personel ds. badań i rozwoju

Format kursu

• Część wykładowa, część dyskusyjna, ćwiczenia i intensywna praktyka

Genomika mikrobiologiczna i metagenomika łączą technologie sekwencjonowania i analizy komputerowej w celu profilowania społeczności mikrobiologicznych, charakteryzowania genomów oraz wykrywania funkcjonalnych cech, takich jak oporność na antybiotyki.

Ten szkolenie prowadzone przez instruktora (online lub na miejscu) jest skierowane do badaczy i bioinformatyków na poziomie początkowym do średniozaawansowanym, którzy chcą wykonać analizę ręczną danych sekwencjonowania genomiki mikrobiologicznej i metagenomiki.

Na zakończenie tego szkolenia uczestnicy będą w stanie:

• Opisać typowe przepływy sekwencjonowania i kluczowe formaty plików używane w genomice mikrobiologicznej.
• Wykonać kontrolę jakości i przetworzenie surowych czytaniach NGS.
• Wykonują profilowanie taksonomiczne za pomocą metod opartych na markerach i k-merach.
• Zmontować i zannotować genomy mikroorganizmów i plazmidy.
• Wykrywać SNPs, budować filogenezy i interpretować strukturę populacyjną.
• Prognozować geny oporności na antybiotyki i podsumowywać profile funkcjonalne.
• Używać powtarzalnych przepływów z Conda, Docker i raportami opartymi na notatnikach.

Format kursu

• Wykłady wprowadzające koncepcje i narzędzia (20%).
• Sesje praktyczne z wykorzystaniem przykładowych zestawów danych (60%).
• Otwarte dyskusje i prowadzone analizy, aby uczestnicy mogli zastosować metody do swoich danych (20%).

Opcje dostosowania kursu

• Aby zażądać dostosowanego warsztatu skupionego na klinicznej, środowiskowej lub przemysłowej metagenomice, prosimy o kontakt w celu umówienia.

To szkolenie prowadzone przez instruktora, na żywo w Polsce (online lub na miejscu) jest skierowane do naukowców i wszystkich zainteresowanych poznaniem podstaw Nanonauki i jej zastosowań.

Po zakończeniu szkolenia uczestnicy będą mogli:

• Zrozumieć dziedzinę nanonauk i nanotechnologii.
• Rozróżnić obiekty w skali nano od tych w skali mikro.
• Poznać podstawową teorię transferu elektronów i energii.

To szkolenie prowadzone przez instruktora w Polsce (online lub na miejscu) jest skierowane do zaawansowanych naukowców sądowych, genetyków i antropologów, którzy chcą zastosować techniki NGS w badaniach sądowych.

Pod koniec tego szkolenia uczestnicy będą mogli:

• Zrozumieć zasady NGS i jego zastosowania w genetyce sądowej.
• Analizować próbki DNA przy użyciu technik NGS.
• Interpretować dane NGS w celu identyfikacji człowieka i określenia pochodzenia.
• Wykorzystywać NGS w przypadku zdegradowanych i złożonych próbek DNA.
• Stosować narzędzia bioinformatyczne do analizy genomowej w genetyce sądowej.
• Zrozumieć kwestie prawne i etyczne w genetyce sądowej.

To praktyczny kurs, który pokazuje, dlaczego programowanie jest potężnym narzędziem w kontekście rozwiązywania problemów biologicznych. W trakcie kursu uczestnicy nauczą się języka programowania Python, który jest powszechnie uważany za zarówno potężny, jak i łatwy w użyciu. Ten kurs można uznać za demonstrację, jak bioinformatyka ułatwia życie biologom.

Kurs został zaprojektowany i jest skierowany do osób bez wykształcenia informatycznego, które chcą nauczyć się programować.

Kurs jest odpowiedni dla:

• Badaczy zajmujących się danymi biologicznymi.
• Naukowców, którzy chcą nauczyć się automatyzować codzienne zadania i analizować dane.
• Menadżerów, którzy chcą poznać, jak programowanie usprawnia przepływ pracy i realizację projektów.

Pod koniec kursu uczestnicy będą potrafili pisać krótkie programy, które pozwolą im manipulować, analizować i przetwarzać dane biologiczne oraz prezentować wyniki w formie graficznej.

Ten kurs ma na celu zapewnienie badaczom zrozumienia zasad projektowania statystycznego i analizy oraz ich znaczenia dla badań w różnych dziedzinach naukowych.

Omówimy niektóre zagadnienia prawdopodobieństwa i metod statystycznych, głównie za pomocą przykładów. Szkolenie zawiera około 30% wykładów i 70% przewodnich quizów i laboratoriów.

W przypadku zamkniętego kursu możemy dostosować przykłady i materiały do konkretnej dziedziny (np. testy psychologiczne, sektor publiczny, biologia, genetyka itp...).

W przypadku kursów otwartych używamy przykładów mieszanych.

Chociaż podczas tego kursu używa się różnych oprogramowań (od Microsoft Excel do SPSS, Statgraphics itp...), jego głównym celem jest zrozumienie zasad i procesów kierujących badaniami, rozumowaniem i wnioskowaniem.

Ten kurs można przeprowadzić jako kurs mieszany, czyli z pracą domową i zadaniami.