Bądźmy w kontakcie

Plan Szkolenia

Wprowadzenie do Fiji i ImageJ

  • Przegląd Fiji i jego zastosowań w badaniach naukowych
  • Zrozumienie architektury ImageJ i wtyczek
  • Instalacja i konfiguracja Fiji w celu uzyskania optymalnej wydajności

Podstawowe techniki przetwarzania obrazów

  • Pozyskiwanie obrazów i formaty importu
  • Regulacja kontrastu, jasności i stosowanie filtrów
  • Metody układania obrazów w stosy i projekcji

Zaawansowana analiza obrazów

  • Techniki segmentacji: progowanie i wykrywanie krawędzi
  • Zliczanie obiektów i analiza cząstek w próbkach histologicznych
  • Pomiar powierzchni, obwodów i innych cech morfologicznych

Praca z próbkami biologicznymi

  • Przetwarzanie obrazów tkanek histologicznych, komórek krwi i glonów
  • Dekonwolucja kolorów i analiza barwionych tkanek
  • Analiza poklatkowa i śledzenie ruchu komórek

Automatyzacja i dostosowywanie

  • Tworzenie i uruchamianie makr do powtarzalnych zadań
  • Korzystanie z wtyczek Fiji do specjalistycznych analiz
  • Podstawowe skrypty w języku ImageJ Macro Language (IJM)

Zarządzanie danymi i raportowanie

  • Eksportowanie wyników i generowanie raportów
  • Opisywanie obrazów i przygotowywanie danych do publikacji
  • Najlepsze praktyki powtarzalnej analizy obrazów

Wymagania

  • Podstawowa znajomość pojęć z zakresu obrazowania biologicznego
  • Znajomość technik mikroskopowych i histologicznych
  • Podstawowa umiejętność obsługi komputera

Grupa docelowa

  • Badacze w dziedzinie biotechnologii i toksykologii środowiskowej
  • Technicy laboratoryjni pracujący z obrazowaniem histologicznym i komórkowym
  • Naukowcy zainteresowani ilościową analizą obrazów
 14 godzin

Liczba uczestników


Cena za uczestnika (netto)

Propozycje terminów

Powiązane Kategorie