Plan Szkolenia

Wprowadzenie do Fiji i ImageJ

  • Przegląd Fiji i jego zastosowań w badaniach naukowych
  • Zrozumienie architektury ImageJ i wtyczek
  • Instalacja i konfiguracja Fiji dla optymalnej wydajności

Podstawowe techniki przetwarzania obrazów

  • Pobieranie i importowanie formatów obrazów
  • Regulacja kontrastu, jasności i zastosowanie filtrów
  • Stosowanie technik stacjonowania i projekcji obrazów

Zaawansowana analiza obrazów

  • Techniki segmentacji: progowanie i wykrywanie krawędzi
  • Liczenie obiektów i analiza cząsteczek w próbkach histologicznych
  • Pomiar powierzchni, obwodów i innych cech morfologicznych

Praca z próbkami biologicznymi

  • Przetwarzanie obrazów tkanki histologicznej, komórek krwi i glonów
  • Dekonwolucja kolorów i analiza zbarwionych tkanek
  • Analiza czasoprzestawna i śledzenie ruchu komórek

Automatyzacja i dostosowywanie

  • Tworzenie i uruchamianie makr dla powtarzalnych zadań
  • Używanie wtyczek Fiji do specjalistycznej analizy
  • Podstawowe programowanie w języku makr ImageJ (IJM)

Zarządzanie danymi i raportowanie

  • Eksportowanie wyników i generowanie raportów
  • Annotowanie obrazów i przygotowywanie danych do publikacji
  • Najlepsze praktyki w obszarze powtarzalnej analizy obrazów

Podsumowanie i dalsze kroki

Wymagania

  • Podstawowe zrozumienie pojęć dotyczących obrazów biologicznych
  • Znajomość mikroskopii i technik histologicznych
  • Podstawowa biegłość komputerowa

Odbiorcy kursu

  • Badacze w biotechnologii i toksykologii środowiskowej
  • Technicy laboratoryjni pracujący z histologicznymi i komórkowymi obrazami
  • Naukowcy zainteresowani ilościową analizą obrazów
 14 godzin

Liczba uczestników


Cena za uczestnika

Propozycje terminów

Powiązane Kategorie